中國市場，大量的在線水質分析儀器被用于企業(yè)廢水污染物排放自動監(jiān)測，這類在線水質分析儀在實際應用中面臨的挑戰(zhàn)是數(shù)據(jù)可靠性和準確度問題，造成問題的原因有。

在線水質分析儀采用的測量原理和測量方法和實驗室標準分析方法不太可能*一致，存在方法誤差；表現(xiàn)出來的現(xiàn)象：儀器可以準確測量標準溶液（常常是單一化合物的水溶液）的濃度；但是對于實際水樣，衡量是否準確的標準是和實驗室人工方法的測量值比對，除了方法誤差，還有可能存在人為誤差的影響。

對樣品預處理的方法與流程和實驗室標準方法不一致。受儀器連續(xù)運行及安裝環(huán)境等一系列條件的限制，在線分析儀器采用的樣品預處理系統(tǒng)很可能和相應水質參數(shù)對應的標準分析方法要求的預處理條件不一致，這樣，也有可能對終的測試結果帶來影響。

針對這些問題，環(huán)境管理部門的技術人員開展了大量的“在線水質分析儀器適用性”研究和比對測試工作，并根據(jù)不同水質指標，制定了嚴格而針對性的比對測試流程和規(guī)范，希望可以找到一個好的解決辦法。

說明：不是所有的在線分析儀器都需要面臨如此嚴格的測量準確度要求。不同的使用目的，對儀器性能的要求也不盡相同。